Na czele komisji stanął Nikołaj Nilowicz Burdenko, Naczelny Chirurg Armii Czerwonej i członek Akademii Nauk ZSRS.
Komisja Burdenki pracowała w Katyniu od 13 do 24 stycznia 1944 roku. W raporcie końcowym stwierdzono, że zbrodni na Polakach dokonali Niemcy między wrześniem a grudniem 1941 roku powielając wcześniejsze tezy funkcjonariuszy NKWD i Smiersza.
W 1946 roku śmiertelnie już chorego Burdenkę odwiedził przyjaciel, były profesor Uniwersytetu w Woroneżu Olszański, któremu Burdenko wyznał: „Wykonując osobisty rozkaz Stalina pojechałem do Katynia, gdzie akurat rozkopywali mogiły. Śmierć [oficerów] nastąpiła w 1940 roku. Dla mnie jako lekarza był to oczywisty fakt niepodlegający żadnej dyskusji”.