Tego dnia 678 roku Agaton został papieżem
Agaton został papieżem po zatwierdzeniu jego wyboru przez cesarskiego egzarchę 27 czerwca 678 roku. Jego celem było dbanie o finanse Kościoła. W tym celu wyprosił on u cesarza zwolnienie z opłat wnoszonych przez nowego papieża do skarbca egzarchy Rawenny, ale w zamian powrócono do praktyki zatwierdzania wyboru Biskupa Rzymu przez samego cesarza.
Dbał o wygląd rzymskich kościołów. Angażował się w propagowanie śpiewów liturgicznych w Anglii. Potępiał monoteletyzm. Dążył także do pojednania z Konstantynopolem i jedności w Kościele, lecz podkreślał znaczenie Rzymu jako strażnika prawdziwej wiary. Za czasów jego pontyfikatu odbył się Synod Trullański, na którym potępiono monoteletyzm oraz poglądy patriarchów Konstantynopola. Był otoczony szacunkiem przez lud rzymski.
Zmarł 10 stycznia 681 roku.
